Manny, Diego ve Sid, büyük bir felaketin ardından kendilerini bambaşka bir kıtada bulurlar. Burada, kaybolan dünyalarından uzaklaşıp yeni bir hayatta kalma mücadelesi vermek zorunda kalırlar. Kahramanlarımız, derme çatma bir gemi yaparak epik bir deniz yolculuğuna çıkarlar. Ancak bu yeni dünyada onları bekleyen yalnızca açık deniz değil; egzotik deniz canavarları ve acımasız korsanlar da büyük tehlike oluşturur. Her adımda yeni bir macera ve tehlike onları beklerken, tarih öncesi sincap Scrat ise bildiğiniz gibi, lanetli meşe palamudunun peşinden gitmekte kararlıdır. Scrat, meşe palamudunu nereye sürüklüyorsa, o yönü takip eder ve kahramanlarımızın peşinden sürüklenerek yine kaos yaratır. Dostluk, aksiyon ve kahkaha dolu bu macera, Manny ve arkadaşlarının en zorlu yolculuklarından biri haline gelir.
